{"id":253973,"date":"2020-03-13T11:15:00","date_gmt":"2020-03-13T10:15:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.futurecobioscience.com\/frontiers-in-microbiology-publica-nuestro-nuevo-flujo-de-trabajo-para-el-diseno-de-marcadores-para-la-deteccion-y-cuantificacion-de-cepas-bacterianas\/"},"modified":"2025-12-18T12:14:28","modified_gmt":"2025-12-18T11:14:28","slug":"frontiers-in-microbiology-publica-nuestro-nuevo-flujo-de-trabajo-para-el-diseno-de-marcadores-para-la-deteccion-y-cuantificacion-de-cepas-bacterianas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.futurecobioscience.com\/pt-pt\/frontiers-in-microbiology-publica-nuestro-nuevo-flujo-de-trabajo-para-el-diseno-de-marcadores-para-la-deteccion-y-cuantificacion-de-cepas-bacterianas\/","title":{"rendered":"A Frontiers in Microbiology publica nosso novo fluxo de trabalho para o design de marcadores para detec\u00e7\u00e3o e quantifica\u00e7\u00e3o de cepas bacterianas"},"content":{"rendered":"\n

Pesquisadores da Unidade de Biologia Molecular do Departamento de R+D+I da Futureco Bioscience publicaram na revista cient\u00edfica Frontiers in Microbiology seu sucesso mais recente: o artigo “Design de ensaios espec\u00edficos de qPCR para cepas bacterianas usando dados de sequenciamento de ponta de ponta e recursos p\u00fablicos, e sua aplica\u00e7\u00e3o para o monitoramento de cepas de biocontrole bacteriano”, que pode ser consultado aqui<\/a>. O artigo descreve e explica o fluxo de trabalho, baseado no sequenciamento de pr\u00f3xima gera\u00e7\u00e3o (#NGS), com o objetivo de projetar marcadores para a detec\u00e7\u00e3o e quantifica\u00e7\u00e3o de cepas bacterianas espec\u00edficas como agentes de biocontrole. O protocolo tamb\u00e9m foi projetado para minimizar a carga de trabalho laboratorial e utilizar ferramentas de bioinform\u00e1tica acess\u00edveis \u00e0 maioria dos pesquisadores. <\/p>\n\n

O fluxo de trabalho come\u00e7a com todo o sequenciamento gen\u00f4mico dos dados NGS e consiste em tr\u00eas etapas: i) Identifica\u00e7\u00e3o de sequ\u00eancias espec\u00edficas de cepa, ii) Projeto de matrizes espec\u00edficas de primer\/sonda para qPCR, e iii) Verifica\u00e7\u00e3o emp\u00edrica do desempenho do ensaio. As duas primeiras etapas envolvem exclusivamente trabalho computacional por pesquisadores com pouca ou nenhuma forma\u00e7\u00e3o em bioinform\u00e1tica, j\u00e1 que os \u00fanicos pr\u00e9-requisitos espec\u00edficos s\u00e3o conhecer as ferramentas da fam\u00edlia BLAST e saber trabalhar com planilhas. Todo o trabalho de bioinform\u00e1tica pode ser realizado usando recursos p\u00fablicos e um computador desktop comum (independentemente do sistema operacional) conectado \u00e0 Internet. O fluxo de trabalho descrito foi verificado em laborat\u00f3rio com cinco cepas bacterianas de quatro g\u00eaneros diferentes em desenvolvimento em nossas instala\u00e7\u00f5es como agentes de biocontrole microbiano. Testes qPCR foram realizados com sucesso em solos, \u00e1guas e tecidos vegetais de diferentes naturezas. Os limites da detec\u00e7\u00e3o e da din\u00e2mica populacional nas diferentes matrizes s\u00e3o compar\u00e1veis aos ensaios projetados por outros meios. Em resumo, nossos cientistas criaram um novo fluxo de trabalho acess\u00edvel, econ\u00f4mico e robusto para obter um grande n\u00famero de marcadores espec\u00edficos de cepa para ensaios qPCR. <\/p>\n\n

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