Productos de alta calidad para la nutrición y protección de los cultivos

Secuenciamos nuestro NoFly

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NoFly es un producto emblemático de Futureco Bioscience. Se registró como producto fitosanitario a nivel europeo en 2013 para combatir la mosca blanca en determinados cultivos en invernadero. Actualmente Futureco Bioscience está ampliando los usos de Nofly a otras plagas (trips) y en campo abierto. Además, estamos trabajando en el registro de una formulación dispersión oleosa, más estable, más penetrante y de fácil aplicación.

El ingrediente activo de NoFly son las esporas del hongo entomopatógeno Paecilomyces fumosoroseus cepa FE9901. Desde su registro inicial, P. fumosoroseus ha cambiado su nombre a Isaria fumosorosea y, posteriormente, a Cordyceps fumosorosea (Kepler et al., 2017). Dentro del género Cordyceps, ahora se incluyen muchas especies de los géneros Isaria y Cordyceps (y otros) que antes se consideraban distantes por lo que esta reclasificación ha avivado la preocupación por la posibilidad de que NoFly pueda producir metabolitos de riesgo para la salud o el medio ambiente. En su momento se demostró que NoFly no los producía, pero las nuevas técnicas moleculares nos permiten ir más allá y saber, además, si podría producirlas en caso de que se dieran las condiciones óptimas para ello.

En Futureco Bioscience hemos decidido secuenciar el genoma C. fumosorosea FE9901 no solo para saber que no es peligroso, sino para confirmar que no puede serlo. Así se confirmará que Nofly es un producto seguro tanto bajo las condiciones de uso actuales, como también bajo cualquier otra condición.

La secuenciación del genoma de un hongo es sustancialmente más complicada que la de una bacteria: el tamaño del genoma es aproximadamente cinco veces mayor, está dividido en varios cromosomas, incluye secuencias repetitivas y los genes presentan intrones (secuencias no codificantes dentro de los genes). Todos estos (y otros) factores dificultan el ensamblaje de las secuencias obtenidas en cromosomas completos. Por ello hemos elegido usar nuestro MinION, ya que la tecnología de lecturas largas de Oxford Nanopore Technologies (ONT) permite obtener secuencias muy largas que facilitan el ensamblaje a costa de una tasa de errores puntuales mayor que en otras plataformas.

Imaginemos que la secuencia del genoma es un puzle; teniendo la misma imagen es más fácil montar un puzle de 5 piezas grandes que uno de 5000 pequeñas, incluso aunque la resolución de la imagen sea peor en el de 5 piezas. Con esta secuenciación pretendemos tener un primer borrador del genoma de C. fumosorosea FE9901. A partir de esta secuencia, comenzaremos a buscar genes de síntesis de metabolitos de riesgo. En el futuro próximo este primer borrador se enriquecerá usando otras plataformas de secuenciación para corregir posibles errores puntuales de secuenciación (i.e. para darle más resolución a la imagen del puzle de 5 piezas)

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Kepler et al. (2017)

Video desarollo de Nofly: aqui

 

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